抗战开始，国内的经济形势急转直下，土山湾的业务也陷入了困境之中。为了维持孤儿院的运作，土山湾各部门不断拓展业务，甚至将其产品远销至非洲各地。我们曾在土山湾出版的广告单页中看到两张为澳门教堂设计的彩绘玻璃图样，一幅是圣母圣诞主题，另一幅是耶稣圣诞主题。几年前曾有机会亲往澳门朝圣，果然在澳门的主教座堂和主教山海崖圣母堂中见到了这两幅玻璃原物。

教堂的另外一个重点是彩色玻璃，在教堂内的彩色玻璃都非常特别，用玻璃制作图像台凸显出圣经里的人物或是故事，如为基督教徒会被这里的彩色玻璃所吸引，在教堂内部总共有56个玻璃窗，31个圆形的玫瑰图案以及25个彩色幅彩色玻璃窗的精美图案，但是在这56个玻璃窗只有4个是最完整无瑕的，其它的玻璃窗都是在1949-1951由当地主教的居民进行一些整修，而这些彩色玻璃窗都是由法国沙特尔省的LorinFirm所制造。
早期花窗玻璃多以圣经故事为内容，以光线配合图案的效果感动信徒。而一些教会所在地本地的传说和神话，也会进入其主题之中。近代以来，花窗玻璃彩色玻璃不仅出现在教堂，也在许多一般建筑、室内空间、产品中获得应用。