提到彩色玻璃，很多人可能都会想到欧洲中世纪哥特式教堂的彩色玻璃窗，比如巴黎圣母院。十二世纪时彩色玻璃随着哥特式大教堂的兴盛而兴起，彩色玻璃窗被广泛用于大教堂和教堂中。除了能增加建筑结构的美感，这时期的彩色玻璃窗也被看作是一种教育资源，可以向广大不识字的民众讲述圣经故事。

彩绘玻璃的繁荣与大批教堂的出现密切相关，主要盛行于罗马式和哥特式建筑。罗马式和哥特式建筑的窗户比较高大，布满整个建筑立面，便于采光。传统壁画中的玻璃镶嵌技法，在这两种建筑结构的教堂中难以运用，因而逐渐退出历史舞台，彩绘玻璃由此兴起。
早期花窗玻璃多以圣经故事为内容，以光线配合图案的效果感动信徒。而一些教会所在地本地的传说和神话，也会进入其主题之中。近代以来，花窗玻璃彩色玻璃不仅出现在教堂，也在许多一般建筑、室内空间、产品中获得应用。